Los objetivos prioritarios del SINEMS han sido planteados en el Contexto de la Nueva Escuela Mexicana cuyo eje fundamental es lograr la transformación social.
Impulsando 4 ejes rectores:
- La implementación del Marco Curricular Común, que facilitará la movilidad de estudiantes entre subsistemas y fortalecerá la formación integral.
- El escalamiento de Educación Dual, la cual vincula programas educativos con proyectos económicos estratégicos en un marco de colaboración entre sector público y privado.
- La transparencia y rendición de cuentas, porque fortalecer la ética como forma de vida de servidores públicos combate las malas prácticas del pasado.
- Promover una cultura de paz, estilos de vida saludable así como el desarrollo de habilidades socioemocionales, porque queremos adolescentes y jóvenes capaces de enfrentar los retos del futuro sanos, seguros y felices.